Hier zijn enkele van de belangrijkste toepassingen:

* Oxidatieve splitsing van vicinale diolen: Perjoodzuur verbreekt selectief de C-C-binding tussen twee aangrenzende hydroxylgroepen (diolen) in een molecuul, wat resulteert in de vorming van twee carbonylverbindingen (aldehyden of ketonen). Deze reactie staat bekend als Malaprade-reactie .

* Splitsing van α-hydroxyketonen en α-hydroxyaldehyden: Vergelijkbaar met de bovenstaande reactie kan perjoodzuur ook de C-C-binding tussen een a-hydroxyketon of a-hydroxyaldehyde splitsen, wat leidt tot de vorming van een carbonylverbinding en een carbonzuur.

* Bepaling van structuren: Periodieke zuuroxidatie is een krachtig hulpmiddel voor het bepalen van de structuur van organische moleculen die vicinale diolen bevatten. De splitsingsproducten kunnen worden geanalyseerd om de oorspronkelijke structuur te identificeren.

* Synthese van complexe moleculen: Periodieke zuuroxidatie wordt gebruikt bij de synthese van verschillende organische verbindingen, waaronder steroïden, koolhydraten en natuurlijke producten.

Andere toepassingen van perjoodzuur:

* Analytische chemie: Perjoodzuur kan worden gebruikt voor de kwantitatieve analyse van bepaalde verbindingen, vooral die welke vicinale diolen bevatten.

* Anorganische chemie: Perjoodzuur wordt ook gebruikt bij sommige anorganische reacties, zoals de oxidatie van jodium en de bereiding van bepaalde metaalzouten.

Belangrijke opmerking: Perjoodzuur is een sterk oxidatiemiddel en moet met zorg worden behandeld. Het kan bijtend zijn en huid- en oogirritatie veroorzaken.