Hier is hoe het werkt:

* Verwijdering van watermolecuul: Een watermolecuul (H₂O) wordt verwijderd uit de twee aminozuren, met name uit de carboxylgroep (-cooh) van het ene aminozuur en de aminogroep (-NH₂) van het andere.

* Vorming van peptidebindingen: Het koolstofatoom van de carboxylgroep van één aminozuur vormt een covalente binding met het stikstofatoom van de aminogroep van het andere aminozuur. Deze nieuwe binding wordt een peptidebinding genoemd .

Het resulterende molecuul is een dipeptide , wat een ketting is van twee aminozuren die zijn gekoppeld door een peptidebinding. Dit proces kan doorgaan en meer aminozuren aan de keten toevoegen om langere polypeptiden en uiteindelijk eiwitten te vormen.