Hier is een vereenvoudigde uitleg van het proces:

1. Snelle begrafenis: Een organisme sterft en wordt snel begraven onder sediment (zoals zand, modder of vulkanische as). Dit voorkomt ontleding en verval.

2. Permineralisatie: Mineralen zijn opgelost in grondwater in de poriën en ruimtes van het begraven organisme. Deze mineralen kristalliseren en vervangen de originele organische materie door rots.

3. Vervanging: Na verloop van tijd wordt het oorspronkelijke materiaal volledig vervangen door mineralen, waardoor een verharde, steenachtige replica van het organisme achterblijft.

Er zijn verschillende soorten fossilisatie, maar permineralisatie en vervanging zijn de meest voorkomende.