Water is een polair molecuul, wat betekent dat het een positief uiteinde en een negatief uiteinde heeft. Polaire moleculen zijn moleculen met een ongelijke verdeling van elektronen, en als gevolg daarvan hebben ze een positief uiteinde en een negatief uiteinde. Niet-polaire moleculen zijn moleculen die een gelijkmatige verdeling van elektronen hebben en als gevolg daarvan geen positief of negatief uiteinde hebben.

Watermoleculen interageren met andere moleculen via waterstofbruggen. Waterstofbinding is een soort intermoleculaire kracht die optreedt tussen een waterstofatoom en een fluor-, zuurstof- of stikstofatoom. Waterstofbinding is een sterke intermoleculaire kracht en is verantwoordelijk voor veel eigenschappen van water, zoals de hoge oppervlaktespanning en het hoge kookpunt.

Polaire moleculen interageren met water via waterstofbruggen. Niet-polaire moleculen hebben geen interactie met water via waterstofbruggen. Niet-polaire moleculen kunnen in water worden opgelost, maar ze interageren niet zo sterk met watermoleculen als polaire moleculen.