Een tomaat is zuur. De pH van een tomaat varieert doorgaans van 4,0 tot 4,5, wat lager is dan de neutrale pH van 7. Dit betekent dat tomaten een hogere concentratie waterstofionen (H+) hebben vergeleken met hydroxide-ionen (OH-), waardoor ze zuur zijn. De zuurgraad van tomaten wordt voornamelijk veroorzaakt door de aanwezigheid van organische zuren zoals onder meer citroenzuur, appelzuur en oxaalzuur. Deze zuren dragen bij aan de zure smaak van tomaten.