Vloeistoffen met waterstofbruggen hebben doorgaans een hogere viscositeit. Dit komt omdat waterstofbruggen sterke intermoleculaire krachten tussen de moleculen creëren, waardoor ze moeilijker langs elkaar heen kunnen stromen. De sterkte van de waterstofbruggen heeft ook invloed op de viscositeit, waarbij sterkere waterstofbruggen tot hogere viscositeiten leiden. Bovendien kunnen de grootte en vorm van de moleculen ook de viscositeit beïnvloeden, waarbij grotere en complexere moleculen de neiging hebben hogere viscositeiten te hebben. Waterstofbinding kan ook leiden tot de vorming van netwerken of clusters van moleculen, waardoor de viscositeit verder toeneemt.