Science >> Wetenschap >  >> Chemie

Enzym voor biokatalyse gebruikt oplosmiddel als substraat

Credit:ACS-katalyse (2024). DOI:10.1021/acscatal.3c05409

Een groot aantal toepassingen in de chemische industrie zijn afhankelijk van de moleculen NADH of NADPH als brandstof. Een team onder leiding van professor Dirk Tischler, hoofd van de werkgroep Microbiële Biotechnologie aan de Ruhr Universiteit Bochum, gebruikte een biokatalysator om hun productie in detail te bestuderen.



De onderzoekers bewezen dat de biokatalysator formiaat dehydrogenase naast formiaat ook formamiden kan omzetten. Dit betekent onder meer dat het enzym ook de moeilijk te verbreken C-N-binding kan splitsen. Daarnaast zijn formamiden een veelgebruikt oplosmiddel.

"Dit opent volledig nieuwe mogelijkheden voor slecht oplosbare NADH-reacties en voor NADPH-afhankelijke reacties", zegt Tischler.

De onderzoekers publiceerden hun bevindingen in het tijdschrift ACS Catalysis op 26 januari 2024.

Formaatdehydrogenase wordt gebruikt in biokatalytische processen om elektronen beschikbaar te maken als brandstof voor verdere reacties door ze uit een substraat te verwijderen. In de huidige toepassingen is het substraat NAD+ en het product NADH. Het afvalproduct is CO2 .

"Dit is in dit geval een goede zaak, omdat het als gas ontsnapt en daardoor voorkomt dat de gewenste reactie omgekeerd plaatsvindt", legt Tischler uit.

Omdat de NADPH-variant – met nog een fosfaatgroep – vaak nodig is als product, creëerde zijn team mutanten van de biokatalysator die NADP+ omzet in het gewenste product.

Dirk Tischler (links), hoofd van de werkgroep, met eerste auteur Artur Maier RUB, Marquard. Credit:Ruhr-Universitaet-Bochum

Wat als de katalysator ook de C-N-binding verbreekt?

Terwijl ze aan het formiaat dehydrogenase werkten, realiseerden de onderzoekers zich dat er weinig bekend was over alternatieve uitgangsmaterialen voor de biokatalysator. "We hebben naar verschillende mogelijke substraten (formiaatderivaten) gekeken en ontdekten dat een C-O-binding altijd wordt verbroken wanneer deze door de biokatalysator wordt omgezet", legt Tischler uit. "Dit bracht ons op een idee:wat als het enzym ook C-N-bindingen zou kunnen splitsen - traditioneel een moeilijke taak om op te lossen?"

Uit verdere tests bleek dat de biokatalysator hiertoe inderdaad in staat is:hij kan ook formamiden, derivaten van het formiaat met een extra verbinding, als uitgangsmateriaal omzetten in stikstof. Omdat formamiden gebruikelijke en goedkope oplosmiddelen zijn, dienen ze bij deze reactie zowel als oplosmiddel als substraat. In deze opstelling is het ook mogelijk om NADH en NADPH te verstrekken. CO2 wordt ook bij deze reacties als afvalproduct geproduceerd en voorkomt door te ontsnappen dat de reacties achteruit gaan.

"Deze reactie is nog nooit eerder beschreven", zegt Tischler. Zijn team toonde aan dat het gebruik van formamiden als elektronenbron voor de vorming van NADPH gelijkwaardige of zelfs iets betere resultaten kan opleveren vergeleken met het conventionele systeem met formiaat.

"Dit opent compleet nieuwe mogelijkheden, omdat onze stabielere mutanten nog steeds actief zijn in tot wel 40% van het volume aan formamiden", zegt de onderzoeker.

Meer informatie: Artur Maier et al., Ontsluiten van de katalytische diversiteit van een formiaatdehydrogenase:formamide-activiteit voor NADPH-regeneratie en aminetoevoer voor asymmetrische reductieve aminering, ACS-katalyse (2024). DOI:10.1021/acscatal.3c05409

Journaalinformatie: ACS-katalyse

Aangeboden door Ruhr-Universitaet-Bochum