University of California, Irvine-onderzoekers hebben een COVID-19-test ontwikkeld die specifieke SARS-CoV-2-varianten met 100% nauwkeurigheid detecteert en identificeert. In een onderzoek bepaalde de RNA-gecodeerde virale nucleïnezuuranalytische reporter correct de alfa-, gamma-, delta-, epsilon- en omicron-genetische mutaties in nasofaryngeale klinische monsters. Dit vermogen zou zorgverleners in staat kunnen stellen om gepersonaliseerde behandelingsbeslissingen te nemen voor een betere patiëntenzorg.

Onlangs online gepubliceerd in het Journal of the American Chemical Society , beschrijft een paper over het onderzoek het ontwerp en de validatie van het Revealr SARS-CoV-2 genotyperingssysteem.

"De COVID-19-pandemie heeft een dringende behoefte gecreëerd aan geïndividualiseerde diagnostische hulpmiddelen die de aanwezigheid van het virus en de specifieke stam kunnen herkennen. Het identificeren en triageren van patiënten die zijn geïnfecteerd met varianten die de virale overdraagbaarheid verhogen en de vaccinbescherming verminderen, is van cruciaal belang voor het beheersen van de verspreiding van de ziekte", zei de corresponderende auteur John Chaput, UCI-professor in de farmaceutische wetenschappen. "Revealr gaat verder dan eenvoudige COVID-detectiemethoden, zoals de veelgebruikte antigeenkit, om de precieze SARS-CoV-2-stam te identificeren die een patiënt infecteert."

Het team analyseerde 34 klinische monsters die begin, midden en eind 2021 in het UCI Medical Center waren verzameld van patiënten met COVID-19-symptomen. Het RNA werd geïsoleerd uit de nasofaryngeale uitstrijkjes en in alle gevallen werd de juiste SARS-CoV-2-variant geïdentificeerd.

"Hoewel Revealr is ontwikkeld als een COVID-detectietest, is de volgende stap om uit te breiden naar andere luchtweginfecties die symptomen delen met COVID-19, zoals griep", zei Chaput. "Het vermogen om enkelpuntsmutaties in een genetische sequentie van DNA of RNA te onderscheiden, maakt het bij uitstek geschikt voor elke genotypering, inclusief kanker. Naast de menselijke gezondheid kan Revealr ook worden gebruikt in forensische of landbouwtoepassingen die momenteel afhankelijk zijn van DNA-sequencing." P>

Het onderzoeksteam omvatte Chaput-lablid Kefan Yang, een afgestudeerde student in chemische en biomoleculaire engineering; Chaput lab-lid Daniel Schuder, een afgestudeerde student in moleculaire biologie en biochemie; en Arlene Ngor, die het Chaput-lab beheert.

De onderzoekers hebben een patentaanvraag ingediend op Revealr genotypering. + Verder verkennen

Onderzoekers ontwikkelen snelle COVID-19-test om varianten in uren te identificeren