1. bacteriën: Eencellige prokaryoten (zonder een kern) met verschillende vormen, maten en metabole mogelijkheden. Ze worden gevonden in alle omgevingen en spelen cruciale rollen in ecosystemen en de menselijke gezondheid.

2. Archaea: Eencellige prokaryoten die verschillen van bacteriën, vaak aangetroffen in extreme omgevingen zoals warmwaterbronnen en zoutmeren. Ze zijn ook essentieel in verschillende ecosystemen en hebben potentiële toepassingen in biotechnologie.

3. Fungi: Eukaryotische organismen (met een kern) die gisten, vormen en paddestoelen omvatten. Ze zijn belangrijke ontleders en spelen een rol bij de productie en geneeskunde van voedsel.

4. protozoa: Eencellige eukaryotische organismen met een breed scala aan vormen en levenscycli. Ze zijn divers in hun habitats en zijn betrokken bij voedselketens en overdracht van ziekten.

5. virussen: Niet-levende entiteiten bestaande uit genetisch materiaal (DNA of RNA) ingesloten in een eiwitlaag. Ze vereisen een gastheercel om te repliceren en kunnen verschillende ziekten veroorzaken.

Het is belangrijk op te merken dat hoewel dit de vijf hoofdgroepen zijn, er andere micro -organismen zijn zoals algen (eukaryotische organismen die fotosynthese uitvoeren), Prions (verkeerd gevouwen eiwitten die ziekte kunnen veroorzaken), en viroïden (Kleine besmettelijke RNA -moleculen). Deze zijn echter vaak niet opgenomen in de "vijf basisgroepen" omdat ze minder divers zijn of meer gespecialiseerde rollen hebben in vergelijking met de hierboven genoemde vijf.