* Prokaryoten missen een echte kern. Het nucleoïde gebied in bacteriën is een duidelijk gebied waar het DNA geconcentreerd is, maar het is niet ingesloten in een membraan zoals de kern in eukaryotische cellen. Er is geen nucleaire envelop rond het bacteriële DNA.

* Prokaryoten missen membraangebonden organellen. Hoewel bacteriën enkele structuren hebben, zoals ribosomen, hebben ze geen complexe organellen zoals mitochondriën, Golgi -apparaten of endoplasmatisch reticulum, die worden ingesloten door membranen in eukaryoten.

Samenvattend: Het nucleoïde gebied is een bepalend kenmerk van prokaryoten, maar het ontbreken van een membraan onderscheidt het van de ware kern van eukaryotische cellen. Deze afwezigheid van een membraangebonden kern is de belangrijkste reden waarom bacteriën worden geclassificeerd als prokaryoten.