De belangrijkste soorten flora en fauna gevonden in aquatische ecosystemen worden voornamelijk bepaald door abiotische factoren , die niet-levende componenten van de omgeving zijn. Deze omvatten:

* Watertemperatuur: Verschillende soorten hebben verschillende temperatuurtoleranties. Warmer Waters ondersteunen een bredere variëteit aan soorten dan koudere water.

* watergehalte: Zoetwater-, brak- en zoutwaterecosystemen ondersteunen elk verschillende soorten flora en fauna.

* Waterdiepte en lichtpenetratie: De beschikbaarheid van het licht neemt af met diepte en beperkt de soorten planten en algen die kunnen overleven.

* waterstroom: Still water versus stromende wateromgevingen ondersteunen verschillende soorten organismen.

* Beschikbaarheid van voedingsstoffen: De overvloed aan voedingsstoffen zoals nitraten en fosfaten beïnvloedt de groei van planten en algen, die op zijn beurt het voedselweb beïnvloeden.

* Opgeloste zuurstofniveaus: Zuurstofniveaus zijn cruciaal voor het overleven van waterorganismen.

* Substraattype: Het type bodemmateriaal (zand, modder, rots) beïnvloedt de soorten organismen die daar kunnen leven.

Biotische factoren , die levende componenten van de omgeving zijn, spelen ook een rol, maar in mindere mate dan abiotische factoren bij het bepalen van de algehele soorten flora en fauna:

* concurrentie: Verschillende soorten concurreren om hulpbronnen, die hun verdeling en overvloed beïnvloeden.

* Predatie: Roofdieren vormen de prooi -gemeenschap.

* Symbiose: Mutualistische relaties kunnen het succes van bepaalde soorten beïnvloeden.

Samenvattend, hoewel biotische interacties belangrijk zijn, zijn de abiotische factoren van een aquatisch ecosysteem de primaire determinanten van de flora en fauna die erin gedijen.