Terwijl sommige enzymen zijn gemaakt van RNA (bekend als ribozymen), zijn de overgrote meerderheid van enzymen eiwitten.

Dit is waarom:

* Structuur: Eiwitten hebben complexe, driedimensionale structuren waarmee ze specifiek aan hun substraten kunnen binden (de moleculen waarop ze werken). Deze specificiteit is cruciaal voor enzymen om specifieke reacties te katalyseren.

* Actieve site: Enzymen hebben een speciaal gebied dat de actieve plaats wordt genoemd, waarbij het substraat bindt en de chemische reactie optreedt. Deze site wordt gevormd door de unieke opstelling van aminozuren in het eiwit.

* katalytische activiteit: De aminozuren binnen de actieve plaats zijn verantwoordelijk voor de katalytische activiteit van het enzym. Ze kunnen het breken en de vorming van bindingen vergemakkelijken, waardoor de reactie sneller doorgaat.

Hoewel RNA als een katalysator kan fungeren, komt het veel minder gebruikelijk dan eiwitenzymen.