1. Kern

Een van de belangrijkste verschillen tussen protoctisten en bacteriën is de aanwezigheid van een kern. Protoctisten hebben een echte kern, die wordt omgeven door een kernmembraan. Dit membraan scheidt het genetisch materiaal (DNA) van de rest van de cel. Bacteriën daarentegen hebben geen kern. In plaats daarvan wordt hun DNA gevonden in een enkel, circulair chromosoom dat zich in het cytoplasma bevindt.

2. Organellen

Protoctisten hebben ook een verscheidenheid aan organellen, dit zijn gespecialiseerde structuren die specifieke functies binnen de cel vervullen. Deze organellen omvatten mitochondriën, chloroplasten en endoplasmatisch reticulum. Bacteriën daarentegen hebben doorgaans geen organellen. In plaats daarvan hebben ze eenvoudiger structuren, zoals ribosomen en flagella.

3. Celwand

Zowel protoctisten als bacteriën hebben een celwand, maar de samenstelling van de celwand verschilt tussen de twee groepen. Protoctisten hebben doorgaans een celwand gemaakt van cellulose, terwijl bacteriën een celwand hebben gemaakt van peptidoglycan.

4. Voedingswijze

Protoctisten kunnen autotroof of heterotroof zijn. Autotrofe protoctisten, zoals algen, kunnen door middel van fotosynthese hun eigen voedsel produceren. Heterotrofe protoctisten, zoals amoeben, moeten andere organismen consumeren om voedingsstoffen te verkrijgen. Bacteriën daarentegen zijn allemaal heterotroof en moeten voedingsstoffen uit andere organismen halen.

5. Reproductie

Protoctisten kunnen zich zowel aseksueel als seksueel voortplanten. Aseksuele voortplanting vindt plaats wanneer een enkele cel zich deelt in twee of meer nieuwe cellen. Seksuele voortplanting vindt plaats wanneer twee cellen samensmelten om een ​​nieuwe cel te vormen. Bacteriën daarentegen planten zich alleen ongeslachtelijk voort.

Over het algemeen zijn protoctisten en bacteriën twee heel verschillende groepen organismen. Protoctisten zijn complexer dan bacteriën en hebben een kern, organellen en een verscheidenheid aan voedingswijzen. Bacteriën daarentegen zijn eenvoudigere organismen die geen kern, organellen of een verscheidenheid aan voedingswijzen hebben.