Sommige van deze voedselbronnen bevinden zich ondergronds, en het gebruik van gereedschap zou de apen kunnen helpen deze te lokaliseren en te gebruiken. Het is bekend dat chimpansees (Pan troglodytes) in het wild stokken gebruiken om naar ondergrondse plantenopslagorganen (bollen, knollen, penwortels en knollen) te graven, maar er is weinig onderzoek gedaan naar hoe kapucijnen voedsel uit de ondergrond halen.
Nu heeft een onderzoeksteam van de Universiteit van São Paulo en het Capuchin Culture Project in Brazilië, en het Duitse Max Planck Instituut voor Dierengedrag en het Max Planck Instituut voor Evolutionaire Antropologie onderzocht hoe bebaarde kapucijnen (Sapajus libidinosus, voorheen Cebus libidinosus) in het wild voorkomen ondergrondse voedselbronnen. Een artikel waarin de bevindingen van het team worden beschreven, verschijnt in Wetenschappelijke rapporten .
Het is bekend dat baardkapucijnen stenen als hamers gebruiken om ingekapselde vruchten en noten open te breken.
Een studie uit 2009 was de eerste waarin observaties werden gerapporteerd van een populatie baardkapucijners in het Braziliaanse Serra da Capivara National Park, een gebied met droge savanne, waarbij bovendien stenen werden gebruikt om ondergronds voedsel te vinden en te verkrijgen, en om ‘gewoonlijk stokken aan te passen en te gebruiken als sondes om dip voor honing en verdrijf prooien (zoals hagedissen, bijen en schorpioenen) uit rotsspleten en stammen, en af en toe voor andere hulpbronnen", aldus het artikel in Scientific Reports .