Science >> Wetenschap & Ontdekkingen >  >> Wiskunde

Hoe enzymen hun efficiëntie verliezen:twee sleutelfactoren

Getty Images/Photodisc/Getty Images

Enzymen zijn complexe eiwitten die fungeren als biologische katalysatoren en reacties versnellen zonder dat ze tijdens het proces worden geconsumeerd. Hun opmerkelijke specificiteit en snelheid komen voort uit een nauwkeurig gevouwen driedimensionale structuur die de actieve site definieert – het ‘zakelijke uiteinde’ waar substraatmoleculen binden en reageren.

Denaturatie

Wanneer omgevingsomstandigheden zoals temperatuur of pH buiten het optimale bereik van het enzym vallen, kan het delicate netwerk van interacties dat de vorm van het eiwit vasthoudt, ontrafelen. Deze onomkeerbare ontvouwing, denaturatie genoemd, vervormt de actieve plaats, zodat deze het substraat niet langer effectief kan binden, waardoor de katalytische activiteit wordt verlamd.

Aminozuurzijketens

Enzymen zijn polymeren van aminozuren, elk gekenmerkt door een centraal koolstofatoom, een waterstofatoom, een aminogroep, een carbonzuurgroep en een unieke zijketen (de “R”-groep). De zijketens dicteren de lokale chemie van het eiwit; ze kunnen fungeren als zwakke zuren of basen en in oplossing specifieke ionisatietoestanden aannemen. Deze ionisatietoestanden beïnvloeden de interacties tussen zijketens, die op hun beurt de algehele driedimensionale vouw van het enzym stabiliseren.

Effect van pH

Elk enzym heeft een optimale pH die het juiste ionisatiepatroon van zijn zijketens ondersteunt, waardoor het eiwit de precieze conformatie kan aannemen die nodig is voor een functionele actieve plaats. Afwijkingen van deze pH veranderen de ladingen in de zijketens, waardoor de subtiele elektrostatische en waterstofbrugnetwerken worden verstoord die de structuur van het enzym in stand houden. Cellulaire buffers houden de pH binnen een smal venster om de enzymactiviteit te behouden.

Effect van temperatuur

Temperatuur beïnvloedt zowel de kinetische energie van reagerende moleculen als de dynamische stabiliteit van eiwitplooien. Een te hoge temperatuur verhoogt de moleculaire beweging tot het punt waarop de structuur van het enzym begint te ontrafelen, wat leidt tot denaturatie. Omgekeerd vermindert een te lage temperatuur de kinetische energie, waardoor de reactie vertraagt ​​tot onder de maximale snelheid. Elk enzym beschikt over een temperatuuroptimum dat deze tegengestelde krachten in evenwicht houdt.

Samenvattend zijn pH-verschuivingen en extreme temperaturen de twee belangrijkste factoren die de efficiëntie van enzymen kunnen verminderen door de ingewikkelde architectuur te destabiliseren die ten grondslag ligt aan hun katalytische vaardigheden.