1. Religieuze oppositie: Darwin's theorie was in tegenspraak met de heersende religieuze kijk op het creationisme, die vasthield dat soorten door God werden geschapen en onveranderlijk. Veel mensen vonden het moeilijk om de natuurlijke selectie te verzoenen met hun religieuze overtuigingen.

2. Gebrek aan bewijs: Terwijl Darwin een schat aan bewijs presenteerde, was zijn theorie gebaseerd op indirecte observaties en conclusies. Sommige wetenschappers voerden aan dat er niet genoeg direct bewijs was om het idee van geleidelijke evolutie te ondersteunen door natuurlijke selectie. Dit werd verder gecompliceerd door het gebrek aan begrip van genetica, dat pas later werd ontdekt.

3. Alternatieve verklaringen: Andere wetenschappers stelden alternatieve theorieën voor de oorsprong van soorten voor, zoals het lamarckisme, die suggereerden dat organismen eigenschappen konden doorgeven die tijdens hun leven werden verkregen. Deze theorieën, hoewel uiteindelijk onjuist, gaven een alternatieve verklaring voor verandering in de tijd.

4. De complexiteit van het leven: De pure complexiteit van het leven op aarde maakte het voor sommigen moeilijk om zich voor te stellen hoe natuurlijke selectie zulke ingewikkelde organismen zou kunnen produceren. Het was moeilijk om te zien hoe willekeurige variaties konden leiden tot de ontwikkeling van complexe aanpassingen.

5. Darwin's schrijfstijl: Hoewel Darwin's "On the Origin of Soorten" een mijlpaal werk was, was het ook een langdurig en complex boek dat voor sommigen moeilijk was om te begrijpen.

6. Sociale en culturele context: Darwin's theorie daagde de heersende sociale orde uit en bracht bezorgdheid uit over de plaats van mensen in de natuurlijke wereld. Sommige mensen vonden het idee dat mensen gerelateerd waren aan apen, en geen speciale plaats in de schepping hadden, onaanvaardbaar.

7. Darwins persoonlijkheid: Darwin zelf was een gereserveerde en voorzichtige man die zijn ideeën niet agressief verdedigde. Dit, in combinatie met zijn slechte gezondheid, betekende dat hij niet zoveel mogelijk over openbare debatten ging als hij had kunnen hebben, waardoor tegenstanders grip kunnen krijgen.

Het is belangrijk op te merken: Hoewel de ideeën van Darwin te maken hadden met een aanvankelijke weerstand, kregen ze uiteindelijk acceptatie door voortdurend onderzoek, bewijsopname en de opkomst van nieuwe wetenschappelijke gebieden zoals genetica.