1. Verwarming: Het grootste deel van de energie die verloren gaat tijdens de energiestroom in het ecosysteem wordt afgevoerd als warmte. Dit gebeurt in verschillende stadia van het energieoverdrachtsproces. Wanneer zonlicht bijvoorbeeld tijdens de fotosynthese op de bladeren van planten valt, gaat een deel van de energie verloren als warmte. Warmte komt ook vrij wanneer dieren energie gebruiken voor activiteiten zoals beweging, spijsvertering en voortplanting.

2. Reflectie en absorptie: Een deel van het zonlicht dat het aardoppervlak bereikt, wordt gereflecteerd door de atmosfeer, wolken, waterlichamen en landoppervlakken. Deze gereflecteerde energie gaat verloren in de ruimte en draagt ​​niet bij aan de energie die beschikbaar is binnen het ecosysteem. Bovendien wordt een deel van het zonlicht geabsorbeerd door stoffen zoals waterdamp en koolstofdioxide in de atmosfeer, waardoor de hoeveelheid energie die beschikbaar is voor organismen verder wordt verminderd.

3. Inefficiëntie van energieoverdracht: De overdracht van energie tussen organismen in de voedselketen is inefficiënt. Slechts een klein deel van de energie die in een organisme is opgeslagen, wordt bij consumptie naar het volgende niveau overgebracht. Wanneer een herbivoor bijvoorbeeld planten eet, wordt slechts een deel van de energie-inhoud van de plant opgenomen door het lichaam van de herbivoor. De rest gaat verloren als afval of wordt gebruikt om verschillende lichaamsfuncties uit te voeren.

4. Ontbinding: Wanneer organismen sterven, worden hun lichamen afgebroken door micro-organismen, bacteriën en schimmels. Tijdens de ontbinding komt een deel van de energie die in de dode organismen is opgeslagen vrij als warmte en koolstofdioxide. Dit proces vermindert de hoeveelheid beschikbare energie in het ecosysteem verder.

5. Export van organisch materiaal: In sommige gevallen kan organisch materiaal uit het ecosysteem worden geëxporteerd, wat tot energieverlies leidt. Wanneer bladeren en ander plantaardig materiaal bijvoorbeeld worden weggespoeld door waterlichamen of wanneer dieren naar andere gebieden migreren, gaat de energie die in deze organismen is opgeslagen verloren voor het lokale ecosysteem.

Over het geheel genomen is het verlies van energie tijdens de energiestroom in een ecosysteem onvermijdelijk als gevolg van verschillende factoren zoals warmtedissipatie, inefficiëntie in energieoverdracht, ontbinding en de export van organisch materiaal. Dit constante energieverlies betekent dat slechts een klein deel van de oorspronkelijke energie-input uit zonlicht uiteindelijk beschikbaar is voor de organismen in het ecosysteem.