Science >> Wetenschap & Ontdekkingen >  >> Chemie

Hoe u het iso-elektrische punt (pI) van een eiwit nauwkeurig kunt berekenen

Door bijdrager
Bijgewerkt op 24 maart 2022

Het iso-elektrische punt (pI) is de pH waarbij een eiwit geen netto lading heeft. Het is een fundamentele eigenschap in de biochemie en beïnvloedt de oplosbaarheid, stabiliteit en interactie met andere moleculen. Omdat de pI afhangt van de aminozuursamenstelling van een eiwit, heb je de exacte volgorde nodig om deze te berekenen.

Stap 1:Verkrijg de eiwitsequentie

Als u de reeks al heeft, gaat u verder met stap 8. Haal deze anders op via UniProt databank.

Stap 2:Zoek UniProt

Voer de eiwitnaam of het trefwoord in het zoekvak in en klik op Zoeken .

Stap 3:Zoek het item

Blader door de resultaten, selecteer de juiste vermelding en noteer het toegangsnummer.

Stap 4:Toegang tot de pI-calculator van ExPASy

Navigeer naar de ExPASy Compute pI/Mw gereedschap.

Stap 5:Voer het toegangsnummer in

Plak het toegangsnummer in het daarvoor bestemde veld en klik op Klik hier om pI/Mw te berekenen .

Stap 6:Verzenden

Klik op Verzenden op het volgende scherm.

Stap 7:Haal het resultaat op

Lees de weergegeven iso-elektrische puntwaarde (pI) af.

Stap 8:Handmatige reeksinvoer (indien nodig)

Keer terug naar de ExPASy-tool en plak of typ de reeks rechtstreeks in het invoerveld.

Stap 9:Berekenen

Klik op Klik hier om pI/Mw te berekenen nogmaals.

Stap 10:Bekijk de pI

Observeer het berekende iso-elektrische punt, dat u nu in uw experimentele ontwerp kunt gebruiken.

Voor meer geavanceerde analyses kunt u overwegen de ExPASy Protein Tools te gebruiken suite, die extra functies biedt, zoals berekening van het molecuulgewicht en pH-afhankelijke eigenschappen.