1. Polariteit en lading: De lipide dubbellaag bestaat uit fosfolipiden, die een hydrofiele (waterminnende) kop hebben en een hydrofobe (watervullende) staart. Dit creëert een barrière die moeilijk is voor polaire moleculen en geladen ionen om door te dringen. Polaire moleculen, zoals suikers en aminozuren, hebben een ongelijke verdeling van elektrische lading, waardoor ze aangetrokken worden tot water en afgestoten door het hydrofobe interieur van het membraan. Evenzo worden geladen ionen, zoals natrium en chloride, ook afgestoten door de hydrofobe staarten.

2. Grootte: Grote moleculen, zelfs als ze niet-polair zijn, kunnen moeite hebben om door de strakke ruimtes tussen de fosfolipide staarten te persen. De dubbellaag heeft een relatief kleine ruimte voor moleculen om door te bewegen en fungeert als een maatbarrière.

Kortom, de lipide dubbellaag werkt als een selectieve barrière, waardoor kleine, niet-polaire moleculen gemakkelijk kunnen passeren, terwijl de doorgang van grotere, polaire moleculen en geladen ionen bepert.