in het atoom:

* waterstof (h): Het eenvoudigste atoom, waterstof heeft één proton en één elektron.

* koolstof (c): Koolstof heeft 6 protonen in zijn kern, die het definieert als een koolstofatoom.

* uranium (u): Een zwaar element met 92 protonen in zijn kern.

in chemie:

* zuren: Protonen vormen de basis van de definitie van zuren in de chemie. Zuren zijn stoffen die protonen (H+) in oplossing vrijgeven.

* Nucleaire reacties: Protonen zijn belangrijke spelers in nucleaire reacties zoals fusie en splijting.

op andere velden:

* deeltjesversnellers: Protonen worden versneld tot hoge energieën in deeltjesversnellers, gebruikt voor onderzoek en medische toepassingen.

* protontherapie: Een vorm van kankerbehandeling die protonen gebruikt om tumoren te richten en te vernietigen.

Het is belangrijk op te merken: Het aantal protonen in een atoom bepaalt het atoomnummer, dat het element definieert. Alle koolstofatomen hebben bijvoorbeeld 6 protonen, ongeacht hoeveel neutronen ze hebben.