1. Een stikstofbasis: Dit is een molecuul dat stikstof bevat en kan een van de vier typen zijn:adenine (A), guanine (G), cytosine (C) of thymine (T) (in DNA) of uracil (U) (in RNA). Elke basis bestaat uit meerdere atomen.

2. Een vijf-koolstofarme suiker: Dit is deoxyribose (in DNA) of ribose (in RNA) en bevat ook meerdere atomen.

3. Een fosfaatgroep: Dit bestaat uit één fosforatoom en vier zuurstofatomen.

Daarom bestaat een nucleotide uit veel Atomen, niet alleen een vast nummer. Het exacte aantal atomen hangt af van het specifieke nucleotide (welke base-, suiker en fosfaatgroep het bevat).

We kunnen echter zeggen dat een nucleotide bestaat uit ten minste tientallen atomen .