1. Waterstofbindingen tussen basenparen: Dit zijn de meest bekende waterstofbruggen in DNA. Ze vormen zich tussen complementaire stikstofbases op tegenovergestelde strengen:

* Adenine (a) vormt twee waterstofbruggen met thymine (t)

* Guanine (G) vormt drie waterstofbruggen met cytosine (C)

* Deze bindingen houden de twee strengen van de DNA Double Helix bij elkaar.

2. Waterstofbindingen binnen een enkele streng: Deze waterstofbindingen dragen bij aan de stabiliteit van het DNA -molecuul, maar ze zijn niet zo sterk als de bindingen tussen basenparen.

* Ze komen voor tussen de suiker-fosfaat-ruggengraat en de stikstofbasen, evenals tussen verschillende secties van dezelfde streng.

Belangrijke opmerking: Hoewel er andere interacties zijn in DNA, zoals van der Waals -krachten, zijn de belangrijkste en cruciale interacties de waterstofbruggen tussen basenparen en binnen een enkele streng.