Hij ontwikkelde een systeem van binomiale nomenclatuur, dat elke soort een unieke tweedelige wetenschappelijke naam geeft (bijvoorbeeld * homo sapiens * voor mensen). Hij classificeerde ook organismen in een hiërarchisch systeem van categorieën, te beginnen met de breedste categorieën (koninkrijk) en naar de meest specifieke (soorten) gaan. Dit systeem, dat vandaag nog steeds wordt gebruikt, is ongelooflijk nuttig geweest voor het organiseren en begrijpen van de diversiteit van het leven op aarde.