Hij voerde een reeks experimenten uit in het midden van de 19e eeuw met behulp van zwanenhalskolfen. Door deze kolven konden lucht binnenkomen, maar voorkwamen stof en andere deeltjes om de bouillon erin te bereiken.

Dit is hoe zijn experimenten werkten:

1. Steriliseer de bouillon: Pasteur gekookte bouillon in zwanenhalskolfen, waarbij bestaande micro-organismen worden gedood.

2. Laat de kolven open: Hij liet de kolven open voor de lucht, waardoor lucht naar binnen kon stromen, maar voorkwam dat stof en deeltjes de bouillon bereiken.

3. Let op de resultaten: De bouillon in de zwanenhekkolven bleef helder en steriel, zelfs na lange periodes.

4. Breek de nek: Pasteur brak vervolgens de nek van sommige van de kolven en stelde de bouillon bloot aan het stof en deeltjes in de lucht.

5. Observatie: De bouillon in de gebroken nekkolfen werd al snel bewolkt met microbiële groei, waaruit bleek dat de micro-organismen uit de lucht kwamen, niet uit de bouillon zelf.

Deze experimenten beschuldigden de langdurige theorie van de spontane generatie, die beweerde dat levende organismen uit niet-levende materie konden voortkomen. Het werk van Pasteur hielp bij het leggen van de basis voor de kiemtheorie van ziekte en bracht een revolutie teweeg in ons begrip van de biologie.