* Gebrek aan een kern: Prokaryotische cellen hebben geen membraangebonden kern om hun genetische materiaal (DNA) te huisvesten. In plaats daarvan bevindt hun DNA zich in een gebied dat de nucleoid wordt genoemd, dat niet wordt ingesloten door een membraan.

* Geen membraangebonden organellen: Prokaryotische cellen missen andere membraangebonden organellen zoals mitochondriën, Golgi-apparaat, endoplasmatisch reticulum, lysosomen, enz. Deze organellen zijn verantwoordelijk voor specifieke functies in eukaryotische cellen.

* kleiner formaat: Prokaryotische cellen zijn over het algemeen veel kleiner dan eukaryotische cellen.

* eenvoudige structuur: De algemene structuur van prokaryotische cellen is eenvoudiger in vergelijking met eukaryotische cellen.

daarentegen hebben eukaryotische cellen een kern- en membraangebonden organellen, waardoor ze veel complexer zijn.