Enterobacter Aerogenes is een gram-negatieve bacterie met een staafvormige morfologie . Dit betekent dat het een celwand heeft die niet de kristalviolet -vlek behoudt die wordt gebruikt in gramkleuring, en zijn cellen verschijnen als korte, cilindrische staven onder een microscoop.

Hoewel de cellulaire opstelling geen bepalend kenmerk is, komt Enterobacter aerogenes meestal voor in paren of korte ketens . Deze opstelling is niet zo strak geclusterd als een "coccus" -opstelling (sferische bacteriën in clusters) of zo uitgebreid als een "filamenteuze" opstelling (lange, kettingachtige structuren).

Het is belangrijk op te merken dat de specifieke opstelling kan variëren, afhankelijk van de groeiomstandigheden en het stadium van de levenscyclus van de bacteriële leven.