* mitochondria: Dit zijn de krachtpatsers van de cel, verantwoordelijk voor cellulaire ademhaling en ATP -productie. Men denkt dat ze afkomstig zijn van aerobe bacteriën die werden overspoeld door vroege eukaryotische cellen. Bewijs voor deze theorie omvat het feit dat mitochondriën hun eigen DNA hebben, dat verschilt van het nucleaire DNA van de cel, en dat ze onafhankelijk repliceren.

* chloroplasten: Alleen in plantencellen gevonden, zijn chloroplasten verantwoordelijk voor fotosynthese. Er wordt aangenomen dat ze afkomstig zijn van fotosynthetische bacteriën, waarschijnlijk cyanobacteriën, die werden overspoeld door vroege eukaryotische cellen. Net als mitochondria hebben chloroplasten hun eigen DNA en repliceren onafhankelijk.

Deze theorie van Organelle Origin staat bekend als de endosymbiotische theorie . Het is een algemeen aanvaarde verklaring voor de evolutie van eukaryotische cellen en wordt ondersteund door een grote hoeveelheid bewijsmateriaal.