Dit is waarom:

* Gebrek aan kern: Prokaryoten hebben hun genetisch materiaal (DNA) in een gebied dat de nucleoid wordt genoemd, maar het is niet ingesloten in een membraan.

* Geen membraangebonden organellen: Ze missen structuren zoals mitochondria, Golgi -apparaat, endoplasmatisch reticulum, lysosomen, enz., Die worden aangetroffen in eukaryotische cellen.

Dit verschil in cellulaire structuur is fundamenteel en definieert het onderscheid tussen prokaryoten (bacteriën en archaea) en eukaryoten (planten, dieren, schimmels, protisten).