* ribosomen: Dit zijn de eiwitsynthesefabrieken van de cel en ze zijn ongelooflijk klein.

* endoplasmatisch reticulum (ER): Dit netwerk van membranen is betrokken bij het vouwen van eiwitten en lipidesynthese. Het heeft een complexe structuur die moeilijk te oplossen is met een lichtmicroscoop.

* Golgi -apparaat: Deze organel verwerkt en verpakt eiwitten en lipiden voor transport. De ingewikkelde structuur is alleen zichtbaar met elektronenmicroscopie.

* mitochondria: Dit zijn de krachtpatsers van de cel en genereren energie door cellulaire ademhaling. Hoewel je soms mitochondria kunt zien met een zeer krachtige lichtmicroscoop, is hun interne structuur alleen zichtbaar met een elektronenmicroscoop.

* lysosomen: Deze organellen zijn verantwoordelijk voor het afbreken van cellulair afval en puin. Hun structuur is te klein om duidelijk te worden gezien met een lichtmicroscoop.

* peroxisomen: Deze organellen zijn betrokken bij verschillende metabole processen, waaronder ontgifting. Hun kleine formaat en structuur vereisen elektronenmicroscopie.

In wezen vereist elke organel die kleiner is dan de resolutielimiet van een lichtmicroscoop (ongeveer 200 nanometer) een elektronenmicroscoop voor visualisatie.