Er zijn twee hoofdtypen elektronenmicroscopen:

* transmissie -elektronenmicroscoop (TEM): Dit type gebruikt een bundel elektronen die door het monster gaan, waardoor een afbeelding wordt gecreëerd op basis van de verzonden elektronen. TEM's bieden een hoge resolutie en kunnen objecten tot een miljoen keer vergroten.

* Scanning Electron Microscope (SEM): Dit type maakt gebruik van een gerichte elektronenstraal die het oppervlak van het monster scannen. De interactie van de elektronen met het monster maakt signalen die worden gebruikt om een ​​afbeelding te construeren. SEM's bieden driedimensionale beelden en zijn met name nuttig voor het bestuderen van de oppervlaktemorfologie van materialen.

Beide soorten elektronenmicroscopen bieden aanzienlijke voordelen ten opzichte van lichtmicroscopen, zoals:

* Hogere resolutie: Elektronenmicroscopen kunnen veel kleinere structuren oplossen dan lichtmicroscopen vanwege de veel kortere golflengte van elektronen.

* grotere vergroting: Elektronenmicroscopen kunnen objecten tot een miljoen keer vergroten, vergeleken met een paar duizend keer voor lichte microscopen.

* Gedetailleerde informatie over materialen: Elektronenmicroscopen kunnen informatie geven over de samenstelling en structuur van materialen die niet kunnen worden verkregen met lichtmicroscopen.

Elektronenmicroscopen worden gebruikt in een breed scala van wetenschappelijke disciplines, waaronder biologie, geneeskunde, materialenwetenschap en nanotechnologie.