1. fototrofie: Dit omvat het gebruik van licht als energiebron. Deze bacteriën worden fototrofen genoemd .

* Fotoautotrofen Gebruik lichte energie om koolstofdioxide om te zetten in organische verbindingen (zoals suikers) via fotosynthese. Ze worden vaak gevonden in omgevingen zoals vijvers en meren. Voorbeelden zijn cyanobacteriën.

* fotoheterotrofs Gebruik lichte energie maar kan geen kooldioxide repareren. In plaats daarvan krijgen ze hun koolstof van organische verbindingen geproduceerd door andere organismen. Deze bacteriën worden vaak gevonden in mariene omgevingen.

2. Chemotrofie: Dit omvat het gebruik van chemische verbindingen als energiebron. Deze bacteriën worden chemotrofen genoemd .

* chemoautotrofen Verkrijg energie uit de oxidatie van anorganische verbindingen, zoals waterstofsulfide, ammoniak of ijzer. Ze kunnen deze energie vervolgens gebruiken om koolstofdioxide te repareren en hun eigen organische verbindingen te maken. Deze bacteriën worden vaak aangetroffen in extreme omgevingen zoals warmwaterbronnen of hydrothermische ventilatieopeningen.

* chemoheterotrofen Verkrijg energie door organische verbindingen af te breken die door andere organismen worden geproduceerd. Ze zijn het meest voorkomende type bacteriën en kunnen worden gevonden in een breed scala van omgevingen, waaronder ons lichaam.

3. Organotrofie: Dit is een subcategorie van chemotrofie waarbij de organische verbindingen die worden gebruikt als energiebronnen zijn afgeleid van andere levende organismen. Organotrofen zijn onder meer:

* saprofytes: Deze bacteriën breken dode organische stoffen af, zoals gevallen bladeren of karkassen van dieren.

* parasieten: Deze bacteriën verkrijgen energie van levende organismen en veroorzaken vaak schade aan hun gastheren.

Het is belangrijk op te merken dat dit brede categorieën zijn, en er is een aanzienlijke diversiteit binnen elk. Sommige bacteriën kunnen bijvoorbeeld zowel lichte als chemische verbindingen gebruiken voor energie.