Waterstof kan echter verschillende soorten bindingen vormen Afhankelijk van waar het mee verbindt:

* Covalente bindingen: Waterstof kan covalente bindingen vormen met andere niet -metalen, zoals zuurstof in water (H₂o) of koolstof in methaan (CH₄). Deze bindingen omvatten het delen van elektronen tussen de atomen.

* ionische bindingen: Waterstof kan ionische bindingen vormen met metalen, zoals bij natriumhydride (NAH). Deze bindingen omvatten de overdracht van elektronen, waardoor ionen worden gecreëerd met tegengestelde ladingen die elkaar aantrekken.

* Waterstofbindingen: Waterstof kan deelnemen aan waterstofbruggen , die zwakke attracties zijn tussen een waterstofatoom covalent gekoppeld aan een sterk elektronegatief atoom (zoals zuurstof of stikstof) en een elektronpaar in het aangrenzende molecuul. Deze bindingen zijn cruciaal voor de structuur en eigenschappen van veel biologische moleculen zoals water en DNA.

Het type bindingswaterstofvormen is dus afhankelijk van de andere atoom waarmee het bindt.