Dit is waarom:

* polariteit: Het elektronegativiteitsverschil tussen waterstof en zuurstof of stikstof creëert een polaire binding, waarbij het waterstofatoom een ​​gedeeltelijke positieve lading (Δ+) draagt ​​en de zuurstof of stikstof die een gedeeltelijke negatieve lading draagt ​​(Δ-).

* Elektrostatische aantrekkingskracht: Het gedeeltelijk positieve waterstofatoom wordt aangetrokken tot het gedeeltelijk negatieve zuurstof- of stikstofatoom van een nabijgelegen molecuul. Deze aantrekkingskracht vormt de waterstofbinding.

Belangrijke opmerking: Waterstofbindingen zijn zwakker dan covalente bindingen maar zijn nog steeds significant in veel biologische en chemische processen.