Nee, het is niet mogelijk om één enkel molecuul met het blote oog te zien. Moleculen zijn extreem klein en hun afmetingen worden doorgaans gemeten in nanometers (nm). Een nanometer is een miljardste van een meter, en de meeste moleculen zijn slechts enkele nanometers groot. De kleinste objecten die met het blote oog kunnen worden gezien, zijn over het algemeen ongeveer 100 micrometer (μm) groot, wat ongeveer 100.000 keer groter is dan een molecuul. Dit betekent dat het zonder de hulp van een microscoop onmogelijk is om een individueel molecuul te zien.