Een onderzoeksteam onder leiding van Prof. Huang Qing van de Hefei Institutes of Physical Science (HFIPS) van de Chinese Academie van Wetenschappen heeft infrarood- en Raman-spectroscopie gebruikt om lysine-acetyleringskenmerken te identificeren, wat een theoretische en experimentele basis biedt voor de analyse van eiwitacetyleringsstructuren in biologische systemen.

Hun resultaten zijn gepubliceerd in Spectrochimica Acta Part A:Molecular and Biomolecular Spectroscopy .

Acetylering is een veel voorkomende en belangrijke eiwitmodificatie in de biologie en speelt een belangrijke regulerende rol in het cellulaire metabolisme. Er zijn twee manieren van eiwitacetylering, de ene is Nε-acetylering die specifiek is voor lysineresiduen, en de andere is N-terminale acetylering die kan optreden op verschillende aminozuurresiduen.

Op dit moment wordt N-terminaal acetyltransferase over het algemeen gebruikt om te labelen om te bepalen of lysineresiduen geacetyleerd zijn, maar de nauwkeurigheid van deze methode is nog steeds controversieel. Het identificeren van eiwitacetylering op moleculair niveau is een van de huidige onderzoeksuitdagingen, en de sleutel is om de acetylering van lysine nauwkeurig te lokaliseren en te karakteriseren om een ​​duidelijk en systematisch begrip te krijgen.

Om dit probleem op te lossen, bestudeerde het onderzoeksteam systematisch de structurele veranderingen en overeenkomstige vibrationele spectrale kenmerken van de drie acetyleringstypes (Nε-Ace-Lys, Nα-Ace-Lys en NαNε-Ace-Lys) van L-lysine via infrarood en Raman spectroscopie-experimenten en dichtheidsfunctietheorieberekeningen. Ze ontdekten dat de infrarood- en Raman-karakteristieke banden van de amidegroep, carboxylgroep en andere groepen kunnen worden gebruikt om verschillende soorten acetylering effectief te identificeren.

Met andere woorden, of lysine geacetyleerd was, kan worden afgelezen aan de kenmerken van infrarood- en Raman-spectra, evenals aan het type lysine.

Tegelijkertijd werd de vibrationele spectroscopie-identificatiestrategie van het team voor acetylering ook geverifieerd in het peptidemodel.

Dit onderzoek levert de vibrationele modusanalyse van geacetyleerd lysine en stelt een spectrale identificatie en een nieuwe karakteriseringsmethode voor lysineacetylering voor. + Verder verkennen

Onderzoekers identificeren sleuteleiwit in een mechanisme dat de levensduur van eiwitten regelt