Binnen de domeinbacteriën zijn er echter twee hoofdcategorieën op basis van hun gram kleuring Resultaten:

* Gram-positieve bacteriën: Deze bacteriën hebben een dikke peptidoglycan -laag in hun celwand, die paars vlekken met gramkleuring.

* gram-negatieve bacteriën: Deze bacteriën hebben een dunnere peptidoglycan -laag en een buitenmembraan, die roze vlekken met gramvlek.

Het is belangrijk op te merken dat deze categorieën gebaseerd zijn op een kleurtechniek en geen taxonomische classificatie. Er zijn veel andere manieren om bacteriën te classificeren, zoals door hun vorm, metabolisme of genetische kenmerken.