* protongradiënt: Het kanaal maakt gebruik van de energie die is opgeslagen in de protongradiënt over het membraan. Protonen, aangedreven door de concentratiegradiënt, gaan van de intermembraanruimte (hoge concentratie) naar de mitochondriale matrix (lage concentratie).

* rotatie: Deze beweging van protonen stimuleert de rotatie van een deel van het ATP -synthase dat de rotor wordt genoemd.

* ATP -productie: Deze rotatie voedt op zijn beurt de synthese van ATP van ADP en anorganisch fosfaat.

Daarom is het ATP -synthasekanaal zeer specifiek en kunnen alleen protonen doorgaan, waardoor een cruciale rol wordt gespeeld in de energieproductie van cellen.