Microscopische roofdieren:

* protozoa: Deze eencellige eukaryotische organismen zijn vaak roofzuchtig en consumeren bacteriën, algen en andere protozoa. Voorbeelden zijn Amoeba, Paramecium en Euglena.

* rotifers: Deze microscopische dieren worden aangetroffen in zoetwaterhabitats en voeden zich met bacteriën, algen en andere kleine organismen.

* nematoden (rondwormen): Sommige nematoden zijn microscopisch en voeden zich met bacteriën, schimmels en algen.

* bacteriofagen: Deze virussen zijn specifiek gericht op bacteriën, injecteren hun genetische materiaal in bacteriecellen en vernietigen ze uiteindelijk.

grotere organismen:

* zoöplankton: Deze groep kleine dieren omvat copepoden, krill en kwallen, die zich voeden met fytoplankton (microscopische algen) en ander zoöplankton.

* filtervoeders: Veel waterdieren, zoals mosselen, oesters en baleenwalvissen, filteren microscopische organismen uit het water.

* Detritores: Deze organismen, waaronder regenwormen en veel insecten, voeden zich met rottende organische materie, die de overblijfselen van microscopische organismen omvat.

* grotere roofdieren: Zelfs grote vissen, amfibieën en reptielen kunnen indirect microscopische organismen consumeren door kleinere dieren te eten die zich ermee voeden.

Andere factoren:

De specifieke organismen die microscopische organismen consumeren, kunnen variëren, afhankelijk van de habitat, het type microscopisch organisme en andere omgevingsfactoren. In zoetwateromgevingen worden bacteriën bijvoorbeeld vaak geconsumeerd door protozoa, terwijl in zoutwateromgevingen fytoplankton worden geconsumeerd door zoöplankton.

Over het algemeen is een enorm en divers scala aan organismen afhankelijk van microscopische organismen voor voedsel, het spelen van cruciale rollen in de balans en functionaliteit van ecosystemen.