1. Gebaseerd op koolstofbron:

* Autotrofen: Deze bacteriën verkrijgen koolstof uit anorganische bronnen zoals koolstofdioxide.

* fotoautotrofen: Gebruik lichte energie om koolstofdioxide te repareren (bijv. Cyanobacteriën)

* chemoautotrofen: Gebruik energie van oxiderende anorganische verbindingen zoals waterstofsulfide, ammoniak of ijzer om koolstofdioxide te repareren (bijv. Sommige zwavel-reducerende bacteriën).

* heterotrofen: Deze bacteriën verkrijgen koolstof van organische verbindingen gemaakt door andere organismen.

* fotoheterotrofen: Gebruik licht als hun energiebron maar verkrijg koolstof van organische verbindingen (bijvoorbeeld enkele paarse bacteriën).

* chemoheterotrofen: Verkrijg zowel koolstof als energie uit organische verbindingen (de meeste bacteriën).

2. Gebaseerd op energiebron:

* fototrofen: Verkrijg energie uit licht (bijv. Cyanobacteriën, paarse bacteriën).

* chemotrofen: Verkrijg energie uit chemische reacties met betrekking tot anorganische of organische verbindingen.

* chemoorganotrofen: Verkrijg energie van organische verbindingen (de meeste bacteriën).

* chemolithotrofen: Verkrijg energie van oxiderende anorganische verbindingen (bijv. IJzer-oxiderende bacteriën, zwavel-oxiderende bacteriën).

3. Gebaseerd op voedingsbehoeften:

* organotrofen: Verkrijg voedingsstoffen van biologische verbindingen.

* lithotrofen: Verkrijg voedingsstoffen uit anorganische verbindingen.

4. Andere belangrijke categorieën:

* saprofytes: Voeden met dode organische stof (bijv. Decomposers).

* parasieten: Verkrijg voedingsstoffen van levende gastheren.

* Symbionts: Leef in nauwe associatie met andere organismen, met een nuttig, schadelijk of neutraal effect.

Belangrijke opmerking: Er is enige overlap tussen deze categorieën. Een fotoautotrofe bacterie is bijvoorbeeld ook een autotrofe, een fototrofe en een lithotrofe.

Samenvattend is er geen specifiek aantal soorten bacteriën op basis van voeding. Het gaat meer om het begrijpen van de diverse manieren waarop bacteriën energie en koolstof verkrijgen, wat leidt tot een breed scala aan metabole strategieën.