Microtubuli zijn holle, cilindrische structuren die deel uitmaken van het cytoskelet van eukaryotische cellen. Ze worden gevormd uit de polymerisatie van het eiwit tubulin .

De opstelling van microtubuli binnen cilia en flagella is zeer specifiek, waardoor een 9+2 structuur ontstaat. Deze structuur is essentieel voor hun beweging.