Dit is waarom:

* Celwandsamenstelling:

* bacteriën: Hebben meestal peptidoglycan in hun celwanden. Dit is een uniek polymeer dat niet in andere domeinen wordt gevonden.

* archaea: Heb verschillende celwandstructuren, die vaak peptidoglycan missen. Ze kunnen pseudopeptidoglycan, polysachariden of eiwitten hebben.

* ribosomaal RNA (rRNA) sequentie:

* rRNA is een belangrijk onderdeel van ribosomen, de cellulaire machines die verantwoordelijk zijn voor eiwitsynthese.

* De sequentie van rRNA -genen is sterk geconserveerd binnen elk domein, maar verschilt aanzienlijk tussen domeinen.

Daarom kunt u, door zowel de celwandsamenstelling als rRNA -sequentie te analyseren, een prokaryote met vol vertrouwen in het bacteriën- of archaea -domein.

Belangrijke opmerking: Hoewel dit de belangrijkste kenmerken zijn, kunnen andere kenmerken ook verder bewijs leveren, zoals:

* Membraanlipidestructuur: Archaea heeft unieke membraanlipiden in vergelijking met bacteriën en eukaryoten.

* Metabole paden: Sommige metabole paden zijn specifiek voor bepaalde domeinen.

* Genexpressie: Archaea heeft enige overeenkomsten met eukaryoten in genexpressiemechanismen.

Uiteindelijk wordt een combinatie van deze functies gebruikt voor een nauwkeurige classificatie.