1. Heterotrofe bacteriën: Deze bacteriën verkrijgen hun voedsel uit biologische bronnen, wat betekent dat ze vooraf gemaakte organische moleculen nodig hebben voor energie en groei. Ze kunnen verder worden ingedeeld in:

* saprofytes: Deze bacteriën ontleden dode organische stof, zoals rottende planten en dieren, het verkrijgen van voedingsstoffen door de afbraak van complexe moleculen.

* parasieten: Deze bacteriën leven op of binnen andere levende organismen (gastheren), het verkrijgen van voedingsstoffen van hun gastheer, die vaak schade veroorzaken.

* mutualisten: Deze bacteriën leven in een symbiotische relatie met een ander organisme, waar beide profiteren. Bijvoorbeeld, bacteriën in de menselijke darmhulp bij de spijsvertering en ontvangen in ruil daarvoor voedingsstoffen.

* Commensalisten: Deze bacteriën leven van of in een ander organisme, die profiteren van de relatie zonder de gastheer te schaden of ten goede te komen.

2. Autotrofe bacteriën: Deze bacteriën kunnen hun eigen voedsel maken, wat betekent dat ze organische moleculen uit anorganische bronnen kunnen synthetiseren. Ze kunnen verder worden ingedeeld in:

* fotoautotrofen: Deze bacteriën gebruiken zonlicht als hun energiebron en zetten koolstofdioxide om in organische verbindingen door fotosynthese. Voorbeelden zijn cyanobacteriën (blauwgroene algen).

* chemoautotrofen: Deze bacteriën verkrijgen hun energie door de oxidatie van anorganische moleculen zoals waterstofsulfide, ammoniak of ijzer. Dit proces staat bekend als chemosynthese. Deze bacteriën leven vaak in extreme omgevingen zoals hydrothermische ventilatieopeningen of diepzeesedimenten.

Samenvattend verwerven bacteriën voedsel door de volgende mechanismen:

* ontbindende organische stof (saprofytes)

* parasitaire relaties met andere organismen

* mutualistische relaties met andere organismen

* Commensalisme

* fotosynthese (fotoautotrofen)

* chemosynthese (chemoautotrofen)

De specifieke methode die een bepaalde bacterie gebruikt, hangt af van de genetische make -up en de omgevingscondities waarin het zich bevindt.