Flagella zijn zweepachtige structuren die uit de cel uitsteken en de protist helpen door zijn omgeving te bewegen.

Hier zijn enkele voorbeelden van flagellated protisten:

* Euglena: Een gemeenschappelijke zoetwaterprotist die zijn flagellum gebruikt voor zowel beweging als voeding.

* trypanosoma: Een parasitaire protist die Afrikaanse slaapziekte veroorzaakt en wordt overgedragen door de tsetse -vlieg.

* Giardia: Een parasitaire protist die giardiasis veroorzaakt, een darminfectie.