- Ademhaling: Zoals alle dieren geven alligators kooldioxide af als bijproduct van cellulaire ademhaling. Dit proces omvat de omzetting van organisch materiaal (zoals voedsel) in energie, waarbij koolstofdioxide vrijkomt als afvalproduct.

- Ontbinding: Wanneer een alligator sterft, valt zijn lichaam uiteen. Dit proces omvat de afbraak van organisch materiaal door micro-organismen, zoals bacteriën en schimmels. Bij de ontleding komt koolstofdioxide als bijproduct in de atmosfeer terecht.

- Habitatwijziging: Alligators creëren belangrijke leefgebieden voor andere organismen, zoals waterplanten en vissen. Deze habitats kunnen koolstof opslaan en helpen deze uit de atmosfeer te verwijderen. Door alligators gecreëerde wetlands kunnen bijvoorbeeld grote hoeveelheden koolstof opslaan in hun veengronden.

Door deze processen spelen alligators een rol bij het reguleren van de hoeveelheid koolstof in het milieu. Hoewel de individuele bijdrage van elke alligator klein kan zijn, kan hun cumulatieve effect een aanzienlijke impact hebben.