1. Membraangebonden organellen: Eukaryotische cellen hebben een complexe interne structuur met membraangebonden organellen, zoals:

* Nucleus: Bevat het DNA van de cel en is verantwoordelijk voor het beheersen van cellulaire activiteiten.

* mitochondria: Krachten van de cel, verantwoordelijk voor energieproductie door cellulaire ademhaling.

* endoplasmatisch reticulum: Een netwerk van membranen die betrokken zijn bij eiwitsynthese en lipidenmetabolisme.

* Golgi -apparaat: Processen en pakketten eiwitten voor secretie.

* lysosomen: Bevatten enzymen die afvalstoffen afbreken.

Prokaryoten missen deze organellen en hun DNA bevindt zich in een gebied dat de nucleoid wordt genoemd, dat niet wordt ingesloten door een membraan.

2. Grotere maat en meer complexe structuur: Eukaryotische cellen zijn meestal veel groter dan prokaryotische cellen en hebben een complexere interne structuur. Dit komt door de aanwezigheid van organellen die cellulaire functies compartimenteren.

3. Cytoskeleton: Eukaryotische cellen hebben een cytoskelet, een netwerk van eiwitvezels dat structurele ondersteuning biedt, helpt bij celbeweging en organeltransport vergemakkelijkt. Prokaryoten missen een echt cytoskelet.

4. Lineaire chromosomen: Eukaryotisch DNA is georganiseerd in meerdere, lineaire chromosomen, terwijl prokaryoten een enkel cirkelvormig chromosoom hebben.

5. Celdeling: Eukaryotische cellen delen door mitose of meiose, terwijl prokaryoten delen door binaire splijting.

6. Seksuele reproductie: Eukaryoten kunnen een seksuele reproductie aangaan, waarbij gameten (sperma en ei) worden fuseert om nakomelingen met genetische diversiteit te produceren. Prokaryoten reproduceren zich aseksueel.

7. Externe structuren: Hoewel sommige prokaryoten flagella voor beweging hebben, kunnen eukaryotische cellen ook cilia hebben, die korter en talrijker zijn, en flagella, die langer en zweepachtig zijn.

Deze verschillen in cellulaire structuur en organisatie dragen bij aan de enorme diversiteit van levensvormen op aarde. Eukaryotische cellen zijn de bouwstenen van complexe meercellige organismen zoals planten, dieren en schimmels, terwijl prokaryoten voornamelijk eencellige organismen zijn, maar ze zijn ongelooflijk overvloedig en essentieel voor veel ecologische processen.