* Obligate aeroben: Deze bacteriën vereisen zuurstof om te overleven. Ze gebruiken het als de uiteindelijke elektronenacceptor in hun ademhalingsproces.

* Obligate anaerobes: Deze bacteriën worden gedood door zuurstof. Ze gebruiken andere moleculen zoals zwavel of nitraat als de uiteindelijke elektronenacceptor in hun ademhalingsproces.

* facultatieve anaerobes: Deze bacteriën kunnen overleven met of zonder zuurstof. Ze geven de voorkeur aan zuurstof en gebruiken het voor ademhaling indien beschikbaar, maar ze kunnen ook overschakelen naar anaërobe ademhaling wanneer zuurstof afwezig is.

* aerotolerante anaëroben: Deze bacteriën kunnen zuurstof verdragen, maar gebruiken het niet voor energieproductie. Ze vertrouwen nog steeds op anaërobe ademhaling.

Daarom hebben niet alle bacteriën zuurstof nodig. Sommigen gedijen in zuurstofvrije omgevingen, terwijl anderen zich kunnen aanpassen aan zowel zuurstofrijke als zuurstofarme omgevingen.