Er zijn vier verschillende stikstofbases in DNA:

* adenine (a)

* guanine (g)

* cytosine (c)

* thymine (t)

Deze bases passen op een specifieke manier:adenine paren altijd met thymine (A-T), en guanine past altijd met cytosine (G-C). Deze paren worden bij elkaar gehouden door waterstofbruggen en vormen de "sporten" van de DNA -ladder.

De zijkanten van de ladder bestaan uit afwisselende suiker (deoxyribose) en fosfaatmoleculen.