Er is geen universeel afgesproken systeem voor het categoriseren van enzymen in alleen drie Hoofdcategorieën. Enzymen worden echter meestal geclassificeerd op basis van het type reactie dat ze katalyseren , wat leidt tot zes hoofdklassen:

1. Oxidoreductasen: Katalyseer oxidatie-reductiereacties (overdracht van elektronen).

2. Transferasen: Katalyseer de overdracht van functionele groepen (bijv. Methyl, fosfaat, aminogroepen).

3. Hydrolasen: Katalyseer de hydrolyse van bindingen (met behulp van water).

4. lyasen: Katalyseer het breken van bindingen zonder hydrolyse of oxidatie, waardoor vaak een nieuwe dubbele binding of ring wordt gevormd.

5. isomerasen: Katalyseer de herschikking van atomen in een molecuul en vormt isomeren.

6. ligasen: Katalyseer het verbinden van twee moleculen, vaak met behulp van energie van ATP -hydrolyse.

Je zou kunnen stellen dat deze zes klassen breed kunnen worden gegroepeerd in drie categorieën :

* Hydrolasen: Moleculen afbreken (inclusief oxidoreductasen, die kunnen worden beschouwd als een speciaal geval van hydrolyse)

* Transferasen: Functionele groepen overbrengen

* ligasen en lyasen: Moleculen maken en wijzigen (exclusief isomerasen, die kunnen worden beschouwd als een subcategorie van deze groep)

Deze categorisatie is echter vereenvoudigd en weerspiegelt mogelijk niet nauwkeurig de complexiteit van de enzymfunctie. Het is belangrijk op te merken dat het zesklasse-systeem de meest gebruikte en geaccepteerde classificatiemethode is.